Outils informatiques de l’OMS, révisions GCEP

Les macros de l’OMS

Pour calculer les scores Z, l'OMS fournit plusieurs outils informatiques pour R, SAS, SPSS, et Stata. Tous sont disponibles sur leur site Web.

Les outils d'application sont disponibles en deux versions :

Les fichiers who2007 calculent les scores Z de poids pour l'âge pour les âges de 5 à 10 ans seulement. L'IMC et la taille pour l'âge sont rapportés pour les 5 à 19 ans.

Donc, nous avons remplacé la table LMS wfawho2007 (poids pour l'âge) par une table révisée avec les paramètres pour les âges 10–19 ans basé sur notre ré-analyse des données de l'OMS (BMC Pediatrics 2014;14:32). Cela nécessitait également des révisions dans les fichiers associés (who2007). Actuellement, nous fournissons les versions pour R, SAS, et Stata. Pour tous, les modifications des fichiers peuvent être identifiées par la recherche de commentaires contenant le mot ‹CPEG›. Les fichiers originaux sont également inclus pour la comparaison.

  • fichier ZIP de igrowup de l’OMS, révisions GCEP (pour R)
  • fichier ZIP de who2007 de l’OMS, révisions GCEP (les versions pour R, Stata, et SAS)

Notez que la plupart des paramètres LMS sont tabulés à intervalles mensuels. Dans nos propres applications, nous avons adjusté l'âge au mois le plus proche avant de rechercher les paramètres LMS correspondants. Mais l'OMS utilise l'interpolation linéaire pour estimer les paramètres LMS «exacts» avant de calculer les scores Z. En général, on peut ignorer les différences. Utilisez à vos propres risques.

Nous avons développé une macro quickZ qui combine les données de igrowup et who2007 pour analyser des enfants entre 0–19 ans avec une seule application pour calculer les scores Z pour le poids, la taille, et l'indice de masse corporelle.

  • fichier ZIP contenant les fichiers de macro quickZ (pour R)

R est disponible gratuitement du CRAN (Comprehensive R Archive Network).


Une macro pour la pression artérielle

Nous avons aussi fourni un macro R pour calculer les scores Z pour la pression artérielle chez les enfants de 2 à 18 ans. Les calculs sont fondés sur l'Annexe B du manuel NIH/NHLBI intitulé Treatment of High Blood Pressure in Children and Adolescents, 4th edition. Une copie est incluse dans le dossier suivant comme hpd_ped.pdf.

  • fichier ZIP avec macro pour la pression artérielle et référence

Veuillez noter que les scores Z pour la taille sont calculés avec les tables LMS des normes de croissance du CDC 2000. Ces valeurs sont utilisées pour calculer les scores Z pour la pression artérielle systolique et diastolique avec les formules de l'Annexe B. Les scores Z pour la taille sont inclus dans les résultats (CDC 2000).


Une macro pour le tour de taille

Nous fournissons une macro R pour calculer les scores Z du tour de taille et ratio tour de taille/grandeur pour les âges 5 à 9 ans. Les calculs sont basés sur nos normes publiées [Pediatric Research 2015;78(6):723–729]. Une copie de la publication est incluse dans le dossier suivant comme PediatrRes_2015.pdf:

  • fichier ZIP avec macro pour tour de taille et ratio tour de taille/grandeur et référence

Une macro pour les nourrissons prématurés

Nous fournissons une macro R pour calculer les scores Z pour les nourrissons prématurés à 22 à 49 semaines. Les calculs sont basés sur les normes publiées [Fenton et al. BMC Pediatrics 2013;13:59].

  • fichier ZIP avec macro pour les nourrissons prématurés

Les applications Shiny

Il ya aussi une option pour ceux qui veulent les macros du GCEP sans la peine des logiciels statistiques. Nous avons créé une application en ligne (Zapps™) pour exécuter les macros du GCEP sur un serveur R (Shiny).

Les données peuvent être transférées sous forme de feuille de calcul (.csv) d'Excel. Un calculateur Excel est également disponible pour utiliser avec des fichiers batch (mais seulement pour Windows).


Si vous avez des questions, des commentaires ou des suggestions, contactez Dr. Atul Sharma ou Dr. Dan Metzger.